ANÁLISE METATAXONÔMICA
O que é?
Microrganismos estão em todo lugar. Invisíveis à nossa percepção, o que não falta é uma grande e diversa gama de seres microscópicos, que vão desde bactérias à fungos e protozoários, em todos os lugares da nosso dia-a-dia. Por causa disso, é inevitável perceber que os papéis que eles desempenham são diversos.
Há espécies que decompõem matéria orgânica morta, sendo essenciais na renovação de nutrientes nos ecossistemas. Há espécies que, ao interagirem com células vegetais, impulsionam o desenvolvimentos de plantas e auxiliam no seu crescimento. Outras habitam a microbiota intestinal humana e são indispensáveis para a digestão de certos alimentos, dentre outras diversas funções.
Algumas, no entanto, são maléficas à saúde e consideradas patógenos, gerando enfermidades ao se desenvolverem, consumindo e matando as células do hospedeiro. Em muitos casos, podem estar presentes em ambiente hospitalar e apresentarem cepas que resistem à ação de antissépticos, só podendo ser descobertas quando já tiverem infectado e agravado a saúde de pacientes hospitalizados.
Tendo em vista a incerteza em se saber quais os microrganismos presentes em determinado ambiente, sua variedade, número de espécies e se podem caracterizar organismos benéficos às atividades humanas ou até mesmo patógenos, a Genesys oferece o serviço de Análise Metataxonômica.
NOSSAS SOLUÇÕES
ANÁLISE METATAXONÔMICA
Tendo em mãos um arquivo em formato .fasta, contendo o sequenciamento do matérial genético presente no microbioma da amostra enviada pelo cliente, utilizamos de programas já consagrados no mercado como FASTQC e Trimmomatic para controle de qualidade da informação recebida.
Em seguida, o arquivo processado é comparado a bancos de dados de genomas de microrganismos, nos levando a elaborar um relatório que expõe e identifica a diversidade de espécies presentes na amostra sequenciada, permitindo então a averiguação da presença de organismos de interesse ou causadores de doenças.
Essa análise é válida para todo o tipo de microbiota, que é o conjunto de micro-organismos que habitam o mesmo ecossistema, sendo referido principalmente à bactérias, também podendo se referir a protozoários. É encontrada em todos os organismos multicelulares, incluindo plantas, e auxilia na reciclagem de nutrientes por meio da decomposição da matéria orgânica. Por isso a importância de uma análise metagenômica nos solos, porém pode ser analisado também de tecidos humano.
A técnica traz avanços nas áreas de produção alimentar, produção de remédio e saúde, podendo analisar os genomas de micro-organismos sem a necessidade de criar culturas de bactérias individuais.